Ciąg dalszy przygód czterech niezwykłych żółwi z Nowego Jorku: Leonarda, Raphaela, Michelangela i Donatella. Wszyscy są mistrzami sztuki walki ninjutsu, a swoje umiejętności wykorzystują, by stawiać czoło złoczyńcom. Po kolejnych akcjach uświadamiają sobie, po co tak naprawdę istnieją. Odkrycie własnego przeznaczenia ma dla nich poważne konsekwencje.Splinter chce pokonać swojego dawnego wroga. Prowadzi do boju żółwie i Potężne Mutazwierzaki.